Лето текущего 2013 года стало настоящим бедствием для региона Амурской области, в частности своими проливными дождями и как результат небывалым паводком. Так вода рядом с плотиной Зейской ГЭС за два летних месяца поднялась с отметки 520 м3/с до показателя 11700 м3/с. Стоит сказать, что такое повышение уровня регистрируется раза в 250 лет. потому, можно сегодня рассуждать о том, что летний паводок 2013 года будет носить статус мощнейшего за 100-летнюю историю наблюдений за рекой Зея.

По сей день плотина данной ГЭС остается основной преградой между жизнью местного населения и водной стихией. Водохранилище этой ГЭС было сформировано таким образом, чтобы обеспечивать продолжительное, исчисляемое ни одним годом, регулирование, так чтобы накапливать весомую часть водного притока благодаря наличию резервной составной части. Так плотина продолжает сдерживать прибывающую воду, препятствуя реальной угрозе огромного затопления близлежащих территорий. Стоит отметить, что если бы не эта ГЭС, то уже сегодня можно было наблюдать с Приамурье страшные наводнения, кстати, до возведения плотины они были регулярным явлением здесь.

Практика, опыт и сама история прошлых лет говорят о том, что амурские реки весьма беспокойны и наводнения в данном регионе реальная и постоянная угроза, таковые случаются здесь раз в 1,5 года. Правда точную периодичность таковых катастроф не возьмется указывать никто, это просто нереально, случается, что они происходят ежегодно и чередуют одно другое, в иной же период их не бывает совсем по нескольку лет. В общей сложности, за прошедшие сто лет на территориях близ Верхнего Амура случилось 60 наводнений, а 8 из них несли катастрофический урон по своей масштабности, на территориях рядом со Средним Амуром наводнений за этот же период было 48 и 7 из них были приравнены к катастрофам местного масштаба. Таким образом, можно установить, что именно катастрофические стихии имеют здесь периодичность равную 10–12 годам.

Зейская ГЭС начала эксплуатироваться в 1975 году, и до настоящего момента полностью окупила и оправдала свое строительство именно на данной территории, хотя бы потому что с помощью нее было предотвращено 14 крупных наводнений и одно катастрофическое, которое могло бы обрушиться на территории низовья реки Зея в 2007 году.